Le FC Ishimbay est un club de football russe basé à Ishimbay, en Bachkirie. Il évolue en troisième division russe, le PFL.

Le club a été fondé en 1947 sous le nom de Neftyanik Ishimbay. En 1959, il a changé de nom pour devenir FC Ishimbay. Le club a remporté la Coupe de l'URSS en 1950 et a terminé quatrième du championnat soviétique en 1953.

Après la chute de l'URSS, le FC Ishimbay a évolué dans les divisions inférieures du football russe. En 2009, il a remporté le championnat de troisième division et a été promu en deuxième division. Le club a terminé 11e de deuxième division en 2010 et a été relégué en troisième division en 2011.

Le FC Ishimbay a remporté la Coupe de Russie de troisième division en 2012. Le club a terminé 10e de troisième division en 2013 et 12e en 2014.